| ESEN innovation AB | Uppsala | — |
| Esentia Clinical Solutions AB | Uppsala | — |
| ESKILSHEM 1:2 Kommanditbolag | Enköping | — |
| Esoterisk Hi-Fi i Uppsala Handelsbolag | Uppsala | — |
| Esprocon AB | Uppsala | — |
| Éternité AB | Knivsta | — |
| Ethno Press Handelsbolag | Uppsala | — |
| Etoile Nordique Kommanditbolag | Bålsta | — |
| Eurodecor-Arts Handelsbolag | Uppsala | — |
| European robotics AB | Uppsala | — |
| Eva och Anders Lindholms Alltjänst AB | Uppsala | — |
| EVelution AB | Uppsala | — |
| EventBuddies AB | Uppsala | — |
| Event City Sweden Kommanditbolag | Enköping | — |
| EWB mat & smak AB | Uppsala | — |
| E.W:s Maskinservice Handelsbolag | Örbyhus | — |
| Excellent Spaces Handelsbolaget | Uppsala | — |
| EXES Fashion AB | Uppsala | — |
| Exolent AB | Uppsala | — |
| Expromo Kommanditbolag | Almunge | — |
| Eyesland Handelsbolag | Uppsala | — |
| E&Z Trädgård Handelsbolag | Märsta | — |
| FABF Holding AB | Uppsala | — |
| Face Work By Jasmine AB | Uppsala | — |
| Fadi Ilo AB | Bålsta | — |
| Fågelbo Gård Handelsbolag | Uppsala | — |
| Fågelsta Svets & Entreprenad Handelsbolag | Östervåla | — |
| FalluddEn KUR Kommanditbolag | Uppsala | — |
| Fam Jernberg Fastigheter Kyrkogatan AB | Enköping | — |
| Famousphone AB | Luleå | — |
| Fandango Coffee Roasters AB | Bålsta | — |
| Fanna krogen AB | Enköping | — |
| Fantasdisc Handelsbolag | Uppsala | — |
| Färgglöd AB | Storvreta | — |
| Farmaceutiska Matlaget Gröne Orm Handelsbolag | Uppsala | — |
| FarShaFa AB | Kristianstad | — |
| Fastighetsaktiebolaget Uppsala Hagby-Brunna 4:1 AB | Uppsala | — |
| Fastighetsbolaget Grimhild Kommanditbolag | Uppsala | — |
| Fastighetsbolaget Radhusen Bernadottestigen AB | Enköping | — |
| Fastighetsförvaltning Rymningen 31:2 Handelsbolag | Uppsala | — |
| Fastighets Radhusen Slädvägen AB | Enköping | — |
| FATA BILVÅRD AB | Sala | — |
| Felix Engström Handelsbolag | Heby | — |
| Feralynx AB | Knivsta | — |
| Fernion AB | Uppsala | — |
| FH Byggservice AB | Vänge | — |
| FHO Fastigheter AB | Örsundsbro | — |
| Fidansöners Pizza-Grill Handelsbolag | Uppsala | — |
| Figlomi AB | Enköping | — |
| Fikastund Öst AB | Alunda | — |