| Enköpings SK Fotboll AB | Enköping | — |
| E.Norberg måleri AB | Uppsala | — |
| ENQ & Company AB | Uppsala | — |
| Enreal Kungsängen 33:1 Kommanditbolag | Stockholm | — |
| Ensys Handelsbolag | Uppsala | — |
| Entrecon Mitt AB | Vattholma | — |
| Enviroad AB | Uppsala | — |
| Eolin Kommanditbolag | Sala | — |
| EO Performance AB | Uppsala | — |
| EPG Specialistläkare AB | Uppsala | — |
| ePIDS AB | Uppsala | — |
| EquiChic Handelsbolag | Uppsala | — |
| Equi Missio Handelsbolag | Enköping | — |
| Equisport Equipment Rental AB | Skutskär | — |
| Equita Talent Partner AB | Uppsala | — |
| Erbesons EFTR. Handelsbolag | Heby | — |
| EREMIT AB | Uppsala | — |
| Erenda AB | Uppsala | — |
| ERF Redovisning AB | Uppsala | — |
| Erikborg Förvaltning AB | Enköping | — |
| Erik Douhan konsult AB | Uppsala | — |
| Eriksson & Holst Handelsbolag | Uppsala | — |
| Eriksson & Levenfalk Handelsbolag | Östhammar | — |
| ERIKSSON & MAGNUSSON TECHNICAL COMPONENT Handelsbolag | Karlholmsbruk | — |
| Erixon Byggmontage AB | Tierp | — |
| Ermis Städ och Trädgårdstjänster Handelsbolaget | Knutby | — |
| Ernäs Konsult AB | Uppsala | — |
| Erslids Allservice AB | Alunda | — |
| ERTEK Fastighetsautomation AB | Uppsala | — |
| Esam Astas AB | Enköping | — |
| Esentia Clinical Solutions AB | Uppsala | — |
| ESKILSHEM 1:2 Kommanditbolag | Enköping | — |
| Esoterisk Hi-Fi i Uppsala Handelsbolag | Uppsala | — |
| Esprocon AB | Uppsala | — |
| Essa Holding AB | Storvreta | — |
| Éternité AB | Knivsta | — |
| Ethno Press Handelsbolag | Uppsala | — |
| Etoile Nordique Kommanditbolag | Bålsta | — |
| Eurodecor-Arts Handelsbolag | Uppsala | — |
| Eva och Anders Lindholms Alltjänst AB | Uppsala | — |
| EVelution AB | Uppsala | — |
| EVEN SWEDEN AB | Uppsala | — |
| EventBuddies AB | Uppsala | — |
| Event City Sweden Kommanditbolag | Enköping | — |
| Evernord AB | Uppsala | — |
| Evocore AB | Alunda | — |
| EWB mat & smak AB | Uppsala | — |
| E.W:s Maskinservice Handelsbolag | Örbyhus | — |
| Excellent Spaces Handelsbolaget | Uppsala | — |
| EXES Fashion AB | Uppsala | — |