| Skalkod Sverige AB | Uppsala | — |
| Skandinavisk Pooldistribution AB | Bålsta | — |
| SkandiNova Handelsbolag | Uppsala | — |
| Skåne Öppna Stadsnät AB | Uppsala | — |
| Skaparkraft Film- & Musikproduktion Uppsala Handelsbolag | Bälinge | — |
| Skaran AB | Uppsala | — |
| Skärgårdspenseln AB | Öregrund | — |
| SKATT KAMMAREN Handelsbolag | Knivsta | — |
| Ski and Tee Sweden Handelsbolag | Knivsta | — |
| Skojiga Lådan Aktiebolag | Gävle | — |
| Skokloster Konsult AB | Skokloster | — |
| Skolextra Uppsala AB | Uppsala | — |
| Skoogs Gröna AB | Fjärdhundra | — |
| Skotte Safety Solutions AB | Uppsala | — |
| Skrotum Kommanditbolag | Uppsala | — |
| SK Städservice AB | Uppsala | — |
| Skubbet Handelsbolag | Krylbo | — |
| SKUMT AB | Tierp | — |
| S.K.U.T.T Service, kommunikation, utbildning, teckenspråk och trädgård Handelsbolag | Skärplinge | — |
| Skyline Engineering and Crew AB | Knivsta | — |
| Skylodge AB | Uppsala | — |
| Skyltapan kommanditbolag | Märsta | — |
| SL Maskin AB | Vattholma | — |
| SL Pump & VVS Handelsbolag | Storvreta | — |
| Små Gröna Ting Kommanditbolag | Uppsala | — |
| Smart Development Sweden Handelsbolag | Enköping | — |
| Smart & Red Handelsbolag | Knivsta | — |
| SmashUpp AB | Uppsala | — |
| Smedslätten Golv Kommanditbolag | Grillby | — |
| SMG Bygg AB | Björklinge | — |
| Smokeworks BBQ AB | Bålsta | — |
| Smygelfh AB | Uppsala | — |
| Snabbt Handelsbolag | Uppsala | — |
| Sneckendahl Fastigheter AB | Grillby | — |
| SNICKARLASSE Byggservice Kommanditbolag | Harbo | — |
| Snits AB | Uppsala | — |
| SNK Vård konsult AB | Uppsala | — |
| SocioQ AB | Storvreta | — |
| Södersjögården AB | Almunge | — |
| Söderström & Törne Aktiebolag | Uppsala | — |
| Sofias stil och style AB | Österbybruk | — |
| Sokraton AB | Uppsala | — |
| Solabacke handelsbolag | Uppsala | — |
| SolaKen's Handelsbolag | Frösön | — |
| Solberget Quarter Handelsbolag | Alunda | — |
| Solima Handelsbolag | Harbo | — |
| Soltan Grill Stockholm AB | Grillby | — |
| Solvallens Fastighets Handelsbolag | Alunda | — |
| Sonic Retreats AB | Uppsala | — |
| Sorelia Consulting AB | Heby | — |