| Saxcé Handelsbolag | Uppsala | — |
| Sayrung Thaimassage Kommanditbolag | Uppsala | — |
| SB Greens Handelsbolag | Bålsta | — |
| SBS Teknik i Uppsala AB | Uppsala | — |
| SB Ventures & Holding AB | Almunge | — |
| Scanator Kjellberg & Co Kommanditbolag | Enköping | — |
| Scandi Alley AB | Uppsala | — |
| Scandinavian Core Work International AB | Björklinge | — |
| Scandinavian Gate Advisory AB | Knivsta | — |
| Scandinavian Media Productions AB | Uppsala | — |
| Scandinavian Nursing Group AB | Johanneshov | — |
| Scandinavian Rhinocare Aktiebolag | Uppsala | — |
| Scandinavian Tungsten AB | Uppsala | — |
| Scend AB | Grillby | — |
| Schneider & Partners AB | Uppsala | — |
| Schöns Vision AB | Grillby | — |
| Schultz Häst Handelsbolag | Enköping | — |
| Schytzer Juridik AB | Uppsala | — |
| Science Market Uppsala AB | Uppsala | — |
| Scimax Consulting Handelsbolag | Uppsala | — |
| Sciting AB | Uppsala | — |
| S C Nygren Handelsbolag - Sulas MC | Uppsala | — |
| Scripta textproduktion Handelsbolag | Uppsala | — |
| Seawine & Event AB | Vittinge | — |
| Seclaro Lön & Redovisning AB | Uppsala | — |
| SecMind Solutions AB | Uppsala | — |
| SEF Consulting AB | Uppsala | — |
| SEIRI Systems AB | Uppsala | — |
| Selenius affär Handelsbolag | Fjärdhundra | — |
| selindo AB | Uppsala | — |
| Semihus AB | Uppsala | — |
| SEM Studio Handelsbolag | Knivsta | — |
| Senadas Hårkonsult AB | Uppsala | — |
| Sensority Consulting AB | Gävle | — |
| Serenius & Hallemar Handelsbolag | Uppsala | — |
| Serhat Kommanditbolag | Alunda | — |
| Serviqo Tjänster Handelsbolag | Uppsala | — |
| Sevis AB | Uppsala | — |
| Sevo Bygg&Logistik AB | Enköping | — |
| SFF i Mälardalen Kommanditbolag | Uppsala | — |
| SF Medium AB | Tierp | — |
| S&G Props Handelsbolag | Uppsala | — |
| Shad Livs Handelsbolag | Knivsta | — |
| SHAFIN House Handelsbolag | Bålsta | — |
| Shah Redovisning AB | Uppsala | — |
| Shammah Restaurang AB | Uppsala | — |
| SHANGRI-LAB AB | Björklinge | — |
| Shant Kommanditbolag | Uppsala | — |
| Sherin Consulting AB | Uppsala | — |
| SheroAL AB | Älvkarleby | — |