| Dahlia Books Handelsbolag | Uppsala | — |
| Dahlmandev AB | Uppsala | — |
| Dahl Projekt och Fastighet AB | Storvreta | — |
| Dalbo Bil AB | Uppsala | — |
| Daleflod-Lindahl Handelsbolag | Uppsala | — |
| Daltek Solutions AB | Uppsala | — |
| Damon Development AB | Uppsala | — |
| Dans och Logopedi - Eva Källkvist AB | Uppsala | — |
| DataKuma AB | Uppsala | — |
| DATUB HANDELSBOLAG | Uppsala | — |
| DB Manufacturing AB | Uppsala | — |
| Dbranch i Sverige AB | Knivsta | — |
| DEAN Konsult AB | Knutby | — |
| DELI DAR AB | Uppsala | — |
| Demhat Handelsbolag | Uppsala | — |
| Demir Healthcare AB | Vattholma | — |
| Details Event by Abeer AB | Storvreta | — |
| Developmental Excellence Uppsala AB | Uppsala | — |
| de Vos Hansson & Haxton Handelsbolag | Uppsala | — |
| D FRANK AB | Uppsala | — |
| Digital Skyltproduktion i Uppsala Handelsbolag | Skyttorp | — |
| Dilvans Handelsbolag | Östervåla | — |
| Din Mäklare Uppsala AB | Uppsala | — |
| DittUppdrag Sjukvård Sverige AB | Uppsala | — |
| Djossou Rückert Landskapsarkitekter Handelsbolag | Uppsala | — |
| DJURAGENTUREN LIMELIGHT ANIMALS Handelsbolag | Knivsta | — |
| Docsek AB | Uppsala | — |
| Doftlabbet AB | Stockholm | — |
| Dokumentär Information, Lundström & Normark Kommanditbolag | Uppsala | — |
| Domevista AB | Björklinge | — |
| Donald Ericsson Fastigheter Kommanditbolag | Uppsala | — |
| Dotweb Solutions AB | Uppsala | — |
| Downtheline handelsbolag | Uppsala | — |
| DOWTS AB | Uppsala | — |
| Dragets Lantbruk Bröderna Johansson Handelsbolag | Uppsala | — |
| Dris Spel o Tobak Kommanditbolag | Uppsala | — |
| Drive Uppsala AB | Uppsala | — |
| Drivverk AB | Uppsala | — |
| Drottninggatans konfektion AB | Uppsala | — |
| DS Glow Clinic AB | Uppsala | — |
| DT Analytics AB | Uppsala | — |
| D&T Fordonsservice AB | Uppsala | — |
| Dwellink International Kommanditbolag | Uppsala | — |
| Dykjobb Sverige AB | Uppsala | — |
| Easy Kommanditbolag | Uppsala | — |
| EB ECOM Handelsbolag | Uppsala | — |
| EBS Digital Laboratory Solutions AB | Björklinge | — |
| Economisto Kommanditbolag | Stockholm | — |
| EcoYield Solutions Sweden AB | Uppsala | — |
| ED BYGG & KAKEL AB | Uppsala | — |